1、产妇在分娩之后，分娩医院就会发放《新生儿疾病筛查须知》给产妇，并且并将新生儿疾病筛查的有关规定、目的、意义、筛查项目等情况告知新生儿的监护人，获得监护人同一之后，监护人就要在《新生儿疾病知情同意书》上签字，然后医院就会对新生儿进行采血。

2、新生儿出生72小时充分哺乳后医院进行规范采血。各接生机构在规定时间内将血样送交市妇幼保健院，市妇幼保健院负责按照新生儿疾病筛查流程规范运行。

3、实验室检测：市新生儿疾病筛查中心实验室在接到标本后2个工作日内进行检测。在5个工作日内出具筛查报告并且发放结果。

4、实验室对可以报告单进行通知监护人并让其在七天内带新生儿进一步进行确诊。

5、确诊、治疗与随访：市新生儿疾病筛查中心对召回可疑阳性者进行复查，并按规定进行疾病诊断和鉴别诊断，在7-10个工作日内出具诊断报告，同时为患儿建立治疗档案， 进入治疗与随访程序。